Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCAO15360 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCAO15360 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCAO15360 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms