Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms