Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STX16-NPEPL1H3BU86 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms