Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF839A8K0R7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms