Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRAMEF25A6NGN4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRAMEF25A6NGN4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF25A6NGN4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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