Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB5A4FU69 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFCAB5A4FU69 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms