Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms