Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms