Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms