Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms