Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL42Q9P2K6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms