Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms