Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms