Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms