Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATG101Q9BSB4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms