Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOXF2Q9BQY4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms