Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GFI1Q99684 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GFI1Q99684 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GFI1Q99684 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms