Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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