Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AVL9Q8NBF6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms