Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms