Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms