Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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ATG9BQ674R7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG9BQ674R7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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