Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms