Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms