Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms