Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EDRF1Q3B7T1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms