Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MYLK3Q32MK0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYLK3Q32MK0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.5 ms