Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms