Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms