Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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