Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SCN9AQ15858 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SCN9AQ15858 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SCN9AQ15858 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SCN9AQ15858 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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SCN9AQ15858 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN9AQ15858 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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