Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms