Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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