Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TCIRG1Q13488 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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