Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SCGB2A2Q13296 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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