Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GPS1Q13098 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms