Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM2Q13029 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM2Q13029 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
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