Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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