Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBBP4Q09028 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms