Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DMPKQ09013 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms