Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TYRO3Q06418 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms