Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF8Q02556 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms