Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF17Q02223 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms