Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-24P63145 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms