Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GNB1P62873 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms