Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NME5P56597 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NME5P56597 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms