Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK1P39086 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms