Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTN2P35609 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms