Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR1P32246 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR1P32246 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms