Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR1BP28222 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR1BP28222 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms